Загружаться будет, но нужно проделать некоторые манипуляции. Все дело в том, что "винда" не "подхватит" чужой контроллер на автомате - ей нужно подсунуть драйвер в процессе инсталляции (когда она просит нажать F6 и т.д.). А без драйвера она, похоже, даже порты хост-контроллера в конфигурационном пространстве найти не может (которые в данном случае не соответствуют стандартным). С драйвером все будет работать, но его нужно записать на дискету (в корне дискеты должен лежать файлик oemsetup.txt).